El Nivel de Postgrado del Área Agropecuaria ofrece el Programa de Maestría en Riego, aprobada según Resolución de COSESUP RCP.S10 N° 227.09, el 13 de agosto de 2009. La Maestría se desarrollará en la modalidad Semi–Presencial con una duración de 24 meses y está dirigida a Profesionales de las Ingenierías Agrícola, Agronómica y Civil. Las inscripciones están abiertas y se tiene previsto el inicio de clases a fine en marzo de 2010.

El Nivel de Postgrado del Área de Energía, Industrias y Recursos Naturales no Renovables ofrece el Programa de Maestría en Electromecánica a desarrollarse a partir del 04 de Enero de 2010. El Programa tendrá un carácter semipresencial, una duración de 24 meses y otorgará el Titulo de Magister en Electromecánica según RESOLUCIÓN CONESUP S13 No. 194.06 .