El Centro de Investigación  y Servicios de Análisis Químicos cuenta con un espacio de 1800 metros cuadrados, distribuidos en tres plantas en dos edificios independientes; El primero hace referencia a cuatro laboratorios para preparación de muestras y análisis preliminar convencional de aguas, suelos, alimentos y vegetales. El instrumental con que cuenta el CISAQ-UNL garantiza la adecuada aplicación de los procedimientos escritos para cada uno de los ensayos asegurando de esta manera resultados reproducibles. Los espacios están diseñado  bajo la Norma ISO 17025. Cuenta con equipos como son: muflas, estufas, balanzas analíticas, cámaras de flujo laminar, cámaras de extracción de gases, medidores de pH, conductividad, BQO, DBO5, viscosímetros, espectrofotómetros UV-V, liofilizador entre los más importantes. Todo el material volumétrico es tipo A con cartas de calibración.

El edificio central consta de dos plantas, en la primera planta se cuenta con un auditorio para capacitación, una bodega de material fungible, un espacio administrativo y tres laboratorios donde se encuentran los equipos AA, Analyzer, ICP y el HPLC. En la planta alta dos laboratorios en el que se encuentra en cromatografo de gases y en el futuro los equipo de espectroscopia y microscopia, además de espacios para investigadores y sala de reuniones. El sistema de gases para cada uno de los equipos instalados estan realizadas bajo extrictas normas de seguridad y los gases utilizados grado cinco. Además de instalaciones de filtros de gases en cada uno de los ingresos a los equipos que así lo requieren.